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Diferentes niveles en el mapeo de cromosomas humanos. La línea que corre verticalmente, en azul, representa la localización de los marcadores A y B, a niveles de mapeo progresivamente más precisos. De esta manera, los investigadores pueden seguir un gen candidato a una enfermedad, desde una baja hasta una muy alta resolución de mapa. El mapa citogenético es el que tiene el menor poder de resolución, indicando las distancias entre distintivos cromosomales (por ejemplo, bandas y puntos de quiebre), visibles bajo microscopio óptico. El bandeo cromosómico puede resolver "distintivos" (features) hasta 5 Mb. El mapa genético, o mapa ligado, mide la frecuencia de recombinación entre dos marcadores ligados, los cuales pueden ser genes o polimorfismos (A y B en este caso). Los mapas híbridos de radiación se producen al quebrar los cromosomas con radiación, y luego identificar el fragmento que contiene el marcador (punto de quiebre). La resolución de este tipo de mapa es comparable a la del mapa genético. En el siguiente nivel de resolución, se separan fragmentos de macrorestricción de 1 a 2 Mb, y los marcadores son localizados y mapeados. Una resolución mayor es la que entregan las librerías ordenadas de cromosomas artificiales de levadura (Yeast Artificial Chromosome, YACs), quienes tienen insertos trozos de 100 a 1000 Kb. Librerías ordenadas de cósmidos llevan insertos trozos más pequeños, de alrededor de 40 Kb. La secuencia de DNA es el nivel de mayor resolución de un mapa, con los sitios de secuencia rotulada (STS), como únicos puntos de referencia.